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Cell Mol Biol Lett | 北京大学深圳医院张新涛教授团队:细胞外囊泡携载CRISPR基因编辑工具研究仍为全球热点

成簇规则间隔短回文重复序列(CRISPR)/CRISPR相关序列(Cas)已被视为基因编辑和转录调控的革命性技术,但因常规病毒载体的致癌作用、包装限制、生产效率偏低、免疫原性和Cas表达寿命短等特点限制了其进一步的转化。CRISPR/Cas的理想递送系统应该是高度安全、稳定、高效和无毒的。细胞外囊泡(EVs)是各种天然细胞在不同的外部或内部条件下分泌的功能物质。其中经过验证的成分可以通过信号通路调节生物过程。尽管许多综述从不同方面总结了基于CRISPR/Cas系统的各种治疗策略,以及使用EVs递送CRISPR相关组分的策略,并提供了相应的细节,但对该领域此类出版物的有意义和全面的分析仍不足。

近日,北京大学深圳医院张新涛研究团队Cellular & Molecular Biology Letters杂志发表题为“Global research trends in CRISPR‑related technologies associated with extracellular vesicles from 2015 to 2022: a bibliometric, dynamic, and visualized study”(Q1,IF=8.3)的研究论文(2023 Dec 2;28(1):99),从视觉和计量的角度预测了使用EVs递送CRISPR领域当前的热门话题和潜在方向。北京大学深圳医院运动医学科主治医师林健静、汕头大学医学院硕士生贾师承、北京大学硕士生焦子路为共同第一作者,北京大学深圳医院运动医学与康复医学中心主任、运动医学科主任张新涛教授、主任医师李伟教授以及山西医科大学第二医院曹福洋博士为文章的共同通讯作者。

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团队通过在WoSCC数据库中收集了与EVs相关的共 219 条记录。并使用R语言、VOSviewer、CiteSpace和GraphpadPrism等软件包分析这项研究的历史、文献的一般特征和关键词。最后,预测了与细胞外囊泡相关的CRISPR技术的热点和最新趋势,并利用可视化分析将这些信息以图表方式呈现。
研究显示来自中国出版物的被引总数最高(2857),其次是美国(2105),韩国排名第三(395)。此外,来自韩国出版物的平均被引次数最高(49.1)。中国(34.4)、西班牙(29.3)和美国(28.5)分列二三四位。此外,H指数被视为衡量学者研究影响力的指标,文章使用GraphPad Prism 8对H指数进行分析。分析发现中国出版物具有最高的H指数(28),其次是美国(27)、英国(10)和德国(8)。

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图1:全球相关出版物的被引频率摘要,以评估出版物的质量
随后,研究团队根据2015 - 2022年的被引爆发量对被引作者进行了分析和统计。被引爆发代表了研究者在短时间内的关注度,反映了作者的研究是否接近当前的热点。文章显示了被引爆发强度最强的是Valadi H(4.34),其次是Thery Clotilde(4.02)、Raposo G.(3.87)、Kowal J.(3.52)、和Li L.(3.21)。文章还展示了过去7年中该领域被引量最高的期刊是PLoS Genetics。而排名第一的被引爆发的文章是《Biogenesis, secretion, and intercellular interactions of exosomes and other extracellular vesicles》,这篇综述全面总结了外泌体和其他分泌性细胞外囊泡的生物起源、分泌和之后的归宿。

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图2:作者、期刊和参考文献中被引爆发的文献计量学分析
研究团队发现了一些该领域的高频关键词,如expression、cells、Cas9等。关键词之间的共现分析和聚类分析揭示了其中的内在联系,文章可视化了317个关键词的同现网络视图,并将其分类为了七个簇:外泌体、纳米囊泡、DNA、基因编辑、基因治疗、癌症治疗、子宫内膜基质细胞,这些簇表明了迄今为止该领域最热门的专题。此外,团队在CiteSpace软件中生成了关键词共现时间轴,从中发现基于CRISPR相关技术的EVs研究在2015年开始激增,并在7年的时间里不断发展。

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图3:对活跃主题、关键词和未来方向的文献计量分析
总而言之,该研究展示了2015年至2022年与EVs相关的CRISPR相关技术的现状和全球趋势。中国贡献了最多的出版物,显示出该领域最高的H指数和被引量。EVs的CRISPR技术的研究将受到全球更多的关注,而外泌体、纳米囊泡、DNA、基因编辑、基因治疗、癌症治疗和间质细胞等是已经存在的研究热点。最后,药物递送、纳米颗粒、蛋白质、血浆/抗体和基因治疗可能是新兴的研究热点。该研究的信息客观反应了该领域的研究现状、研究热点及研究前沿方向,为细胞外囊泡在CRISPR技术应用中的后续研究提供新的信息和思路。
该项工作受到了国家自然科学基金、广东省企业联合基金的资助。近年来,张新涛教授团队长期致力于“腱骨愈合、骨软骨损伤修复的机制、材料与转化”领域的研究,相关系列研究成果相继发表于《Cellular and Molecular Biology Letters》《Bioactive Materials》《Nanophotonics》《Composites Part B: Engineering》《Materials Science and Engineering: C-Materials for Biological Applications》《Science and Technology of Advanced Materials》等国际权威期刊。未来本团队将继续基于临床难题,开展进一步针对促进腱骨愈合、外泌体开发和使用、骨和软骨修复机制与再生策略方向的研究。
参考文献:
Global research trends in CRISPR-related technologies associated with extracellular vesicles from 2015 to 2022: a bibliometric, dynamic, and visualized study. Cell Mol Biol Lett. 2023;28(1):99. Published 2023 Dec 2. doi:10.1186/s11658-023-00507-z

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