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有没有办法确认组织细胞外囊泡的细胞来源

经过这些年的发展,细胞外囊泡已经被大众所熟知,细胞外囊泡的研究也逐渐形成了一个独立的研究方向和领域。目前的研究已经表明细胞外囊泡广泛参与到生物体的组织发生、疾病损伤和再生修复过程中。
细胞外囊泡内容物主要包括DNA、RNA和蛋白质。虽然细胞外囊泡起源于细胞,但其内容物的种类构成和丰度与起源细胞并不完全一致,这是由于细胞外囊泡的内容物经过了主动分选富集。虽然细胞外囊泡表面也具有来自起源细胞的表面蛋白,但是蛋白的组成和丰度并不完全一致。这些因素造成了组织中细胞外囊泡的起源细胞分析一直存在困难。之前,有研究尝试使用特定的表面蛋白作为推测细胞外囊泡起源细胞的依据(例如,L1CAM被推定为神经元来源细胞外囊泡的标记),但是效果并不理想。详情请参考之前的报道:【Nature Methods】L1CAM是否可以作为神经元来源细胞外囊泡的标志物还有待商榷
有没有其他更为可靠的方法分析和推定组织细胞外囊泡的主要来源呢?近期,由北京大学的学者们在Journal of Extracellular Vesicles上发表的论文“Extracellular vesicles from lung tissue drive bone marrow neutrophil recruitment in inflammation.”提出了一种通过单细胞测序和细胞外囊泡蛋白质谱数据联合分析的方法进行细胞外囊泡起源细胞的推定。
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简单的说,首先将肺组织通过蛋白酶和DNA酶处理成悬浊液,将悬浊液与培养液混合后在摇床上继续震荡20分钟,以充分解离肺组织。然后收集上层清夜,并通过超速离心和密度梯度超速离心拿到纯度较高的肺组织来源的细胞外囊泡用于蛋白质谱分析。随后,将细胞外囊泡蛋白质谱分析数据与公共数据库中肺组织单细胞测序数据进行联合分析,找出编码肺组织细胞外囊泡蛋白的基因,并分析这些基因在单细胞数据中的表达情况。最后,利用作者设计的计算方法,计算不同细胞类群对细胞外囊泡的贡献程度。
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​目前,我们对细胞外囊泡的研究通常集中于体外培养的特定细胞来源的细胞外囊泡。由于组织细胞外囊泡的来源复杂,因此目前的研究还较为少见。但是对组织细胞外囊泡的研究对于我们深入认识细胞外囊泡的生理功能具有重要的意义。虽然,该方法可能还存在一定的局限,但是对组织细胞外囊泡来源的推测鉴定提供了很好的思路。这一研究报道将有利于我们完善组织细胞外囊泡来源推定的技术路线和策略。感兴趣的朋友可以读一读原文。

参考文献:Extracellular vesicles from lung tissue drive bone marrow neutrophil recruitment in inflammation

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