【2016.01.08】This Week in Extracellular Vesicles - 外泌体资讯网
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【2016.01.08】This Week in Extracellular Vesicles

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exosome现在受到越来越多的人重视,由于exosome研究的带动,整个extracellular vesicle领域都处在一个上升阶段。相信会有越来越多的人们进入这个领域,因此hzangs开始尝试每周对extracellular vesicles领域的新paper做一下总结,选择一些与大家分享和介绍,大家有什么需求或者想要了解的,也可以给我留言。
这周publication的extracellular vesicles领域的论文总共有72篇,涵盖了免疫、干细胞、肿瘤、损伤修复等诸多方面,有研究性论文,也有综述性文章。影响因子普遍在5分以下。由于exosome在肿瘤的转移、抗药性等方面的功能报道和机制研究相对较多,所以不再对该方向的普通文章做评述。根据这些论文的研究方向和研究方法,我选了10篇做简要介绍,这些文章不分影响因子大小,仅以方(xiao)向(bian)新(xi)颖(huan)值得一读、有借鉴意义为选择标准。

1、Studying extracellular vesicle transfer by a Cre-loxP method. 【Nat Protoc】 Cre-loxP系统用于研究胞外膜泡在细胞间的转运交流

摘要:胞外囊泡在细胞间传递作为一种细胞间交流、传递大量的生物功能分子的重要方式日益受到重视。通过对in vitro或者 ex vivo的方式分离纯化出的胞外囊泡在生物功能方面的作用研究逐渐深入,胞外囊泡的作用也逐渐被重视起来。虽然可以在体外通过亲脂染料标记保外囊泡再回输到体内,进行囊泡的示踪。但是,在体内条件下研究体内细胞分泌的胞外囊泡的摄取还面临着很大的挑战,这主要是因为目前的技术没有办法研究內源分泌的特定胞外囊泡在体内的行为,无法在体内区分摄取过特定胞外囊泡(內源产生,非体外输入)和没有摄取过特定囊泡的细胞。最近,Carrie Maynard & Jacco van Rheenen等研究者在Cre-loxP系统上进行技术研发,以荧光标记的携带Cre重组酶位点的报告细胞摄取表达Cre重组酶细胞分泌的胞外囊泡为模型,来解决一系列体内体外实验问题。

该文章 我曾在之前一篇文章评述中进行过详细评述和分析。详见:http://www.exosome.com.cn/forum. ... 3D1&_dsign=1d8cc0ed

2、Extracellular Vesicles in Renal Diseases: More than Novel Biomarkers?【J Am Soc Nephrol】胞外膜泡在肾脏疾病领域:不仅仅是生物标志物?

摘要:从尿液和循环系统获得的胞外囊泡是在肾脏疾病方面潜在的诊断标志物。尿液中的胞外囊泡含有蛋白质可以仅来自肾单位的所有部分,而循环系统胞外囊泡可能含有血小板,免疫细胞,和内皮细胞的成分的。除了它们作为肾和血管损伤的标记物诊断作用,胞外囊泡成分一方面可以作为肾脏疾病的潜在生物标志物,另一方面也可能通过参与细胞间通讯而影响肾脏健康和诸如感染之类的疾病。然而,目前胞外囊泡的知识多是通过少数病人样本,甚至是体外实验获得的。由于技术的不统一和方法学上的缺陷,我们很难完整分离胞外囊泡的各个组分和整体分析胞外囊泡的成分组成。随着新技术和标准的制定和应用,相信对胞外囊泡的成分和生物学更精确的分析会逐渐躲起来。

该文对extracellular vesicles在肾脏疾病方面的研究进展进行了回顾和总结,并且对胞外囊泡的标准化分离鉴定做了一定的阐述。这篇文章适合肾脏疾病方面的研究者参考。

3、Chromatographically isolated CD63+CD81+ extracellular vesicles from mesenchymal stromal cells rescue cognitive impairments after TBI.【Proc Natl Acad Sci U S A】亲和层析分离的间充质干细胞来源的CD63、CD81阳性胞外囊泡可以治疗创伤性脑损伤造成的认知障碍。

摘要:由细胞分泌的胞外囊泡(EV)呈现出极具吸引力的新治疗方法,但在该领域进展还有一些限制:在胞外囊泡的质量会随着生产细胞的类型和生理状况而变化;用于分离胞外囊泡的方法目前难以实现大规模应用;评估治疗效果的实验还有待开发。在本文中,我们通过使用人骨髓间充质干细胞/基质细胞(MSCs)在无蛋白质培养基中培养产生胞外囊泡,通过亲和层析方法分离培液中的胞外囊泡,后期实验建立了一种体内测定胞外囊泡在创伤性脑损伤(TBI)后抑制神经炎症效果的小鼠模型。利用该模型,我们证明了在TBI处理后短时间内使用MSC分泌的胞外囊泡进行静脉注射,可以改善小鼠在1个月后的空间认识和学习障碍。

胞外囊泡对损伤修复方面的作用已经有大量的报道,其在神经系统创伤修复过程中的作用却并不多见,从事神经系统损伤修复相关研究的朋友们可以参考一下这篇paper。

4、Identification of EDIL3 on extracellular vesicles involved in breast cancer cell invasion.【J Proteomics】 筛选鉴定发现胞外囊泡中的EDIL3会影响乳腺癌细胞的侵袭浸润能力。

摘要:癌细胞来源的细胞外囊泡与癌症的病程紧密相关。本文从定量蛋白质组分析角度入手,分析了低浸润能力的MCF-7和高浸润能力MDA-MB-231 两个代表性乳腺癌细胞系的细胞外囊泡成分。组学分析发现并鉴定到这两种细胞胞外囊泡中的270中蛋白质。这里,我们报道胞外囊泡中EDIL3蛋白的一个新功能,它可以促进乳腺癌的侵袭浸润,并可以在小鼠体内促进肺转移灶的行程。这种侵袭浸润很可能是通过整合素-FAK信号在乳腺癌中发挥作用的。失活EDIL3可以降低乳腺癌的侵袭浸润能力。这一发现丰富了对乳腺癌侵袭浸润的认识,靶向胞外囊泡中的EDIL3可能是治疗乳腺癌的一个新疗法。

该文章的研究内容是目前胞外囊泡领域的热点,因此该论文创新性并不高。但是该文章从蛋白组学角度入手筛选潜在的蛋白靶点是大家值得参考的。准备通过胞外囊泡寻找蛋白靶点的朋友可以了解一下这篇论文。

5、Extracellular vesicles - new tool for joint repair and regeneration.【Nat Rev Rheumatol】 胞外囊泡-关节修复和再生的新工具。

摘要:关节滑液和软骨胞外基质中细胞来源的细外囊泡(EV)在关节的发育和稳态调节中发挥着作用。尽管目前胞外囊泡在这方面功能的认知不够,但仅有的数据已经暗示其在关节疾病的诊断和关节修复再生的治疗中具有重要作用。除了直接注射治疗性胞外囊泡进入目标部位,通过水凝胶将胞外囊泡导入创伤部位也是潜在的新治疗手段。基于目前对关节滑液和关节组织中胞外囊泡成分(包括小分子RNA)参与关节稳态(或病态)调节的报道,我们总结过去并展望了胞外囊泡在利用再生医学方法治疗关节损伤方面的应用前景。

文章对胞外囊泡在关节损伤修复和再生方面的研究进展进行了汇总,并展望了其未来的应用前景。 从事损伤修复方面研究的朋友可以参考一下。

6、Development of a magnetic bead-based method for the collection of circulating extracellular vesicles.【N Biotechnol】一种通过磁珠捕获循环系统中胞外囊泡的新方法。

摘要:细胞释放不同类型的细胞外囊泡。这些胞外囊泡含有来自其母细胞的蛋白质和核酸,可以是用于诊断应用中。本研究的目的是建立一个方便的方法来收集循环系统中的胞外囊泡,用于检测mRNA或其他分子。由于细胞磷脂膜表面富含annexin,因此我们使用包被有annexin A5磁珠进行试验,以测试该磁珠在体外试验中俘获凋亡小体和其他膜泡结构的能力。我们的研究结果表明,该磁珠可以捕获诱导系统中60%的凋亡小体,从血浆、血清或者培液中捕获足够多的胞外囊泡用于qPCR检测RNA成分。此外,我们在反复冻融处理的血浆中重复该实验并同样得到理想结果。通过该磁珠可以在荷瘤小鼠的血清中分离出足够qPCR使用的胞外膜泡,通过该系统从荷瘤小鼠腹水(血清中不行)中分离出足够进行蛋白分析的胞外囊泡。总之,我们已经开发出一种基于磁珠分离的方法用于分离体液中的胞外囊泡。该系统在诊断方面具有巨大潜力。

一篇方法学论文,对于探索胞外囊泡在临床诊断中应用方法的研究者可以作为参考。

7、Role of extracellular vesicles in autoimmune diseases.【Autoimmun Rev】胞外囊泡在自身免疫病中的作用。

摘要:胞外囊泡主要包括外泌体和微膜泡等膜泡成分。胞外囊泡可以介导细胞 - 细胞通信,并参与包括验证、免疫、血管生成、应激反应、衰老、增殖和细胞分化等许多过程。越来越多的证据表明,胞外囊泡在自身免疫调节和自身免疫病中具有重要作用。本文对其在自身免疫病方面的研究进展进行了总结。

一篇review。不必多说。

8、Emergence of exosomal miRNAs as a diagnostic biomarker for Alzheimer's disease.【J Neurol Sci】 外泌体中miRNA在阿尔兹海默症(AD)诊断中的作用

摘要:阿尔茨海默症(AD)是最常见的进行性病变疾病,其特征是记忆丧失和认知衰退。它是一种复杂的疾病,环境和遗传对其发病都具有重要作用。目前对该病的诊断主要通过对疑似病人的认知功能考察和体液生化分析。目前对AD的研究主要集中在两方面:有效的治疗和在发生不可逆的神经损伤前确诊。外泌体中含有其母细胞的细胞成分(尤其是miRNA),很多研究表明其特定成分可以成为疾病诊断的特诊标志物。此外,一些报道也证实miRNA表达谱在诊断神经退行性疾病方面的潜力。目前,体液中外泌体miRNA已经被报道具有作为诊断AD的标志物的潜力,并切可能成为一种用于治疗AD的强有力的工具。在这篇综述中,我们总结了外泌体生物标志物的最新研究进展,并且总结了外泌体在AD领域内的研究进展,同时我们还提供了外泌体形成、分离、功能研究相关的方法。

AD作为一个常见的老年病正随着社会老龄化问题被大家重视起来。该文章对外泌体在AD领域的研究做了总结。很适合刚刚进入该领域的研究者阅读。

9、Delivery of Small Interfering RNAs to Cells via Exosomes.【Methods Mol Biol】通过外泌体呈递siRNA。

摘要:外泌体携带有来自于母细胞的RNA、蛋白质、脂质等多种生物分子,是细胞-细胞通讯的一种重要介质。人细胞来源的exosome可以作为治疗性siRNA的传递载体。本文介绍了我们通过电转将siRNA转移到多种细胞来源的外泌体中并提供给受体细胞,受体细胞成功摄取携带有siRNA的外泌体,我们通过流式、共聚焦显微镜、印记杂交对受体细胞摄取携带有外源siRNA外泌体这一过程进行了验证。

一篇利用exosome包被siRNA用于治疗的探索性文章。研究药物载体的朋友们可以借以参考。

10、Lung cancer exosomes initiate global long non-coding RNA changes in mesenchymal stem cells.【 Int J Oncol 】肺癌来源的外泌体可以改变间充质干细胞长链非编码RNA的表达情况。

摘要:这篇文章不再提供翻译的摘要。该文章并无太多新意。提到这篇文章的目的是让各位读者学习一种追随潮流来发paper的方法。该文章的题目看上去很高大上,又是外泌体、又是lncRNA。但是细细读来就会发现,该文章既没有研究外泌体,有没有研究lncRNA。他们只是报道说肿瘤来源的外泌体刺激MSC可以改变MSC的lncRNA表达谱。 这是一个很取巧的方法,其本质与“某药物可以改变某细胞的表达谱”是一样的。只需要一个刺激,大规模测序或芯片筛选表达差异基因,再进行一下数据分析即可。但是后者可能1分的文章都不大愿意要,而这篇文章却发在了一个3分的杂志上。归根结底是因为它把一些科研圈的流行元素放了进来。曾经还有一篇肿瘤抗药性的文章,把外泌体、noncoding RNA、肿瘤干细胞等概念联系到了一起,机制靠在了老套的Notch pathway,最后文章发在了20多分的杂志上,数据夯实是一方面,善于跟风也是一个发高分的因素呢。并不提倡大家这样做科研,但是对于毕业压力山大的各位硕士博士们,这也是一个不错的方法。

今天的总结就到此未知喽。希望大家能够有所收获。至少要记住把自己的研究向热点靠拢,可以提高文章档次。欢迎大家来论坛找我。我是 hzangs~

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已有1条评论
  1. lyb993 2016-01-23 10:28:00

    hzangs,辛苦了,总结的很好,学到了很多东西。这方面研究的论文为啥影响因子都这么小啊?