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【接地气小文章推荐二】组织和血浆外泌体中miRNA编辑差异与肺癌发生的相关性

microRNA中的RNA编辑(RNA editing)现象是癌症中的新型生物标志之一。在这项研究中,俄亥俄州立大学的研究人员利用87个NSCLC(非小细胞肺癌)样本的miRNA测序数据来研究RNA编辑,所述样本与来自The Cancer Genome Atlas(TCGA)的正常肺组织进行比较,并结合26个血浆衍生的外泌体独立样本进行分析。通过检测编辑水平和microRNA编辑表达,他们检测到NSCLC肿瘤和正常组织之间的失调的microRNA编辑事件。 有趣的是,研究人员还第一次检测到循环外泌体microRNA中的编辑位点,具有非侵入性区分正常和肿瘤样本的能力。 值得注意的是,在miR-411-5p的第五位的编辑在NSCLC患者的组织以及血浆外泌体中显著失调,这表明外泌体中的miRNA的改变与肺癌生物学相关。

7.11-2-1

图:血浆来源的外泌体NSCLC样品中的miRNA编辑。 (a)正常和肿瘤(早期/晚期)血浆来源的NSCLC样品中miRNA编辑水平和与野生型miRNA对应的统计数据。 (b)miR-411的茎环核苷酸序列图。 5’端成熟序列以蓝色突出显示,绿色为3’端。 种子序列核苷酸用红色表示,编辑位点用黄色突出显示。 (c)在正常、早期和晚期NSCLC患者肿瘤组织样品中检测到的两种编辑的miRNA的表达值(RPM)和编辑水平的箱形图。

参考文献:Nigita G, Distefano R, Veneziano D, Romano G, Rahman M, Wang K, Pass H, Croce CM, Acunzo M, Nana-Sinkam P. (2018) Tissue and exosomal miRNA editing in Non-Small Cell Lung Cancer. Sci Rep 8(1):10222.

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